Nature Communications:PC1-PC2通道脂质门控机制解析,助力ADPKD机制研究与靶向治疗
来源:华源再生医学公众号 | 作者:ARM | 发布时间: 2026-08-05 | 80 次浏览 | 🔊 点击朗读正文 ❚❚ | 分享到:
本研究利用冷冻电镜技术,解析了PC1-PC2通道在不同状态下的10种高分辨率构象。研究提出了“门闩-楔子”模型:普通磷脂作为“门闩”关闭通道,而纤毛富集的7β,27-DHC作为“楔子”嵌入变构口袋,驱动TOP/VSD结构域旋转120°,从而调控孔道开放。该发现阐明了ADPKD发病的脂质门控机制,并锁定了潜在的药物干预靶点。


常染色体显性多囊肾病(ADPKD)是一种常见的遗传性疾病,约每1000人中就有1人患病,主要表现为肾脏多发囊肿并逐渐增大,最终导致肾功能障碍。该病由PKD1/PKD2基因突变引起,其编码的多囊蛋白-1(PC1)与多囊蛋白-2(PC2)形成定位于初级纤毛的Ca²⁺通透离子通道复合物。纤毛富集的独特脂质(如7β、27-DHC等)对该通道功能具有关键调控作用,但其门控机制尚不明确。


近日,西湖大学施一公院士团队在《Nature Communications》上发表了一篇题为《Structural basis of lipid-dependent allosteric gating mechanisms for PC1-PC2 ion channel》的研究论文。该研究利用冷冻电镜技术,解析了野生型(WT)PC1-PC2通道在2.3–3.2 Å分辨率下的三种构象,识别了孔道内结合的磷脂分子及第三个PC2亚基的动态变化;同时,还解析了功能获得型(GOF)PC1-PC2通道(即AA通道)的四种构象及7β,27-DHC结合结构,揭示了脂质通过变构作用调控通道孔道的分子机制,为理解PC1-PC2通道的脂质依赖性门控提供了重要见解。


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WT通道三种构象的对比与磷脂调控

研究团队利用冷冻电镜解析了PC1-PC2通道在不同状态下的高分辨率结构。在野生型(WT)通道中,内源性磷脂(如PG、PA)通常阻塞在孔道中央,使通道处于失活状态。通过对比不同构象(WT-Class I/II 与 WT-Class III),发现当磷脂解离时,伴随着第三个PC2亚基的TOP结构域(TOPIII)和电压感受域(VSDIII)发生显著的旋转,通道进入一种无磷脂的“预开放”状态。电生理实验进一步证实,人为突变磷脂结合残基(如R4094D、R4100D)可破坏孔道内的磷脂结合,从而诱导通道产生功能获得型(GOF)电流。

图1. PC1-PC2通道的脂质诱导失活与变构激活。

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图2.在孔道结构域中设计的用于削弱磷脂结合的突变,能够增强PC1-PC2通道的活性。

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AA通道四种构象的开放机制

研究团队进一步解析了功能获得型(GOF)PC1-PC2通道(PC2上携带L677A/N681A双突变,简称AA突变体)——即AA通道的四种连续构象(Class I至IV)。结构显示,随着TOPIII/VSDIII逐步向外旋转(最高达120°),孔道内的关键阻塞磷脂结合空腔的残基(PC1-Leu4099和PC2-Phe676)发生位移,导致离子渗透路径逐步扩大。在AA-Class IV中,孔道最窄处的半径增加至约1.7 Å,足以让部分水合的阳离子通过,确认为离子传导的开放状态。突变体验证了收缩位点2(constriction site 2)在调节离子渗透中的核心作用。

图3. GOF PC1-PC2通道(L677A/N681A)的门控展示了TOPIII的逐步运动。

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7β,27-DHC的结合与作用位点

既往研究发现7β,27-DHC被认为是PC1-PC2通道的激活剂。结构解析显示,在7β,27-DHC存在下通道呈现三种构象(其中两种与WT-Class I/II类似,另有一种新构象WT-Class IV)。在新构象WT-Class IV中,由S1III/S4III、S5PC1/S6bPC1、S5III/S6III和S4-S5III形成的空腔内存在一个明确的7β,27-DHC结合位点,该分子被多个疏水残基(如L224, L228, L4031等)包裹,并通过氢键和阳离子-π相互作用进一步稳定。质谱分析证实了重组蛋白与该分子的特异性结合,且结合口袋突变体(G4028W、E4025R)的结合量显著减少

图4. 激活剂7β,27-DHC楔入由PDPC1和PC2III相邻片段形成的空腔,并变构调节孔道大小。

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四、“门闩与楔子”门控模型

综合所有结构数据,团队提出了PC1-PC2通道的机械-脂质门控模型。在没有刺激时,内源性磷脂(PG/PA)像“门闩”一样锁住通道。当受到刺激(如机械力)时,“门闩”拔出,TOPIII/VSDIII像“旋转门”一样摆动进入中间态(WT-Class III)。在纤毛微环境中,高浓度脂质7β,27-DHC像“楔子”一样卡入结构,迫使旋转门进一步转动,使通道进入更开放但仍为非导电的状态

图5. PC1-PC2通道在不同细胞器上的工作模型。

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综上,PC1-PC2通道的门控是一个由脂质分子(门闩与楔子)和蛋白质亚基(变构旋转)协同调节的精密过程。7β,27-DHC作为内源性“楔子”,通过变构效应重塑孔道几何形状,是维持纤毛正常生理功能的关键。

本研究解析了PC1-PC2通道原子分辨率的10种构象,明确了PC1孔道结构域及磷脂结合位点,揭示了带正电残基(R4094、R4100)在脂质门控中的关键作用。野生型与功能获得型通道均显示TOPIII/VSDIII构象变化可传递至PC1孔道,提示存在亚基特异性的变构激活机制,该机制与机械敏感钾通道的脂质介导失活相似。7β,27-DHC结合位点已被鉴定,但通道仍处于非导电态,提示可能需要额外辅助因子才能实现完全激活。这些发现为理解ADPKD发病机制及设计靶向治疗策略提供了重要的结构基础。

参考文献:

Chen M, Wang Z, Shi Y, et al. Structural basis of lipid-dependent allosteric gating mechanisms for PC1-PC2 ion channel. Nat Commun. Published online July 8, 2026. doi:10.1038/s41467-026-75084-8